Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Babam1Q3UI43 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Babam1Q3UI43 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Babam1Q3UI43 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Babam1Q3UI43 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Babam1Q3UI43 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Babam1Q3UI43 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Babam1Q3UI43 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Babam1Q3UI43 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Babam1Q3UI43 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Babam1Q3UI43 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms