Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plxnd1Q3UH93 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxnd1Q3UH93 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnd1Q3UH93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnd1Q3UH93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnd1Q3UH93 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnd1Q3UH93 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxnd1Q3UH93 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxnd1Q3UH93 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms