Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc58Q3UGP9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc58Q3UGP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc58Q3UGP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc58Q3UGP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc58Q3UGP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms