Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops9Q3U898 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops9Q3U898 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops9Q3U898 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops9Q3U898 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms