Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VwceQ3U515 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VwceQ3U515 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VwceQ3U515 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VwceQ3U515 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VwceQ3U515 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VwceQ3U515 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VwceQ3U515 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VwceQ3U515 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms