Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd33bQ3U0L2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd33bQ3U0L2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd33bQ3U0L2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd33bQ3U0L2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd33bQ3U0L2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms