Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd6Q3TY92 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd6Q3TY92 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd6Q3TY92 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd6Q3TY92 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd6Q3TY92 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd6Q3TY92 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd6Q3TY92 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms