Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc28Q3TX51 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc28Q3TX51 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc28Q3TX51 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc28Q3TX51 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc28Q3TX51 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms