Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.1 ms