Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RogdiQ3TDK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RogdiQ3TDK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RogdiQ3TDK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RogdiQ3TDK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RogdiQ3TDK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RogdiQ3TDK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RogdiQ3TDK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms