Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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