Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ13

WDR72, WD repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR72Q3MJ13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR72Q3MJ13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR72Q3MJ13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR72Q3MJ13 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR72Q3MJ13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR72Q3MJ13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR72Q3MJ13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR72Q3MJ13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR72Q3MJ13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR72Q3MJ13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms