Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEACAM16Q2WEN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM16Q2WEN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM16Q2WEN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM16Q2WEN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM16Q2WEN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms