Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HKDC1Q2TB90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HKDC1Q2TB90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HKDC1Q2TB90 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HKDC1Q2TB90 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms