Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSNAXIP1Q2TAA8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSNAXIP1Q2TAA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNAXIP1Q2TAA8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSNAXIP1Q2TAA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms