Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC96Q2M329 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC96Q2M329 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC96Q2M329 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC96Q2M329 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC96Q2M329 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC96Q2M329 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC96Q2M329 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC96Q2M329 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC96Q2M329 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC96Q2M329 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms