Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Treml2Q2LA85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Treml2Q2LA85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Treml2Q2LA85 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Treml2Q2LA85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Treml2Q2LA85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml2Q2LA85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms