Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIDA1Q1XH10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIDA1Q1XH10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIDA1Q1XH10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIDA1Q1XH10 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.9 ms