Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC142Q17RM4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC142Q17RM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC142Q17RM4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC142Q17RM4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC142Q17RM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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