Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL8BQ17RB0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTL8BQ17RB0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTL8BQ17RB0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL8BQ17RB0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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