Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TXNRD1Q16881 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TXNRD1Q16881 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TXNRD1Q16881 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TXNRD1Q16881 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TXNRD1Q16881 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TXNRD1Q16881 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TXNRD1Q16881 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TXNRD1Q16881 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TXNRD1Q16881 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
TXNRD1Q16881 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TXNRD1Q16881 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TXNRD1Q16881 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TXNRD1Q16881 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TXNRD1Q16881 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms