Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACKR1Q16570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR1Q16570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR1Q16570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR1Q16570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR1Q16570 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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