Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY1Q16526 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY1Q16526 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY1Q16526 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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CRY1Q16526 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY1Q16526 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
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CRY1Q16526 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
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CRY1Q16526 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRY1Q16526 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
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