Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA3Q16281 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNGA3Q16281 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGA3Q16281 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
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