Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85BQ15834 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85BQ15834 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85BQ15834 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85BQ15834 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85BQ15834 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85BQ15834 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85BQ15834 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85BQ15834 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85BQ15834 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85BQ15834 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85BQ15834 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85BQ15834 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
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