Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEBPEQ15744 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEBPEQ15744 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEBPEQ15744 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPEQ15744 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPEQ15744 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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