Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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TWIST1Q15672 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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TWIST1Q15672 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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TWIST1Q15672 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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TWIST1Q15672 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TWIST1Q15672 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TWIST1Q15672 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TWIST1Q15672 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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TWIST1Q15672 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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TWIST1Q15672 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TWIST1Q15672 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TWIST1Q15672 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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TWIST1Q15672 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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