Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MED1Q15648 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MED1Q15648 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
MED1Q15648 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MED1Q15648 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MED1Q15648 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MED1Q15648 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MED1Q15648 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MED1Q15648 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MED1Q15648 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MED1Q15648 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MED1Q15648 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MED1Q15648 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MED1Q15648 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MED1Q15648 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MED1Q15648 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MED1Q15648 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MED1Q15648 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MED1Q15648 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MED1Q15648 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MED1Q15648 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MED1Q15648 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MED1Q15648 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MED1Q15648 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
MED1Q15648 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MED1Q15648 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MED1Q15648 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MED1Q15648 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MED1Q15648 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MED1Q15648 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MED1Q15648 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MED1Q15648 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MED1Q15648 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MED1Q15648 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MED1Q15648 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MED1Q15648 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MED1Q15648 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MED1Q15648 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MED1Q15648 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
MED1Q15648 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MED1Q15648 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MED1Q15648 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MED1Q15648 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MED1Q15648 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MED1Q15648 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MED1Q15648 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MED1Q15648 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MED1Q15648 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MED1Q15648 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MED1Q15648 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MED1Q15648 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MED1Q15648 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MED1Q15648 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MED1Q15648 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
MED1Q15648 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MED1Q15648 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
MED1Q15648 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MED1Q15648 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
MED1Q15648 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MED1Q15648 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MED1Q15648 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MED1Q15648 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MED1Q15648 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MED1Q15648 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
MED1Q15648 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
MED1Q15648 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MED1Q15648 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MED1Q15648 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MED1Q15648 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MED1Q15648 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MED1Q15648 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MED1Q15648 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MED1Q15648 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MED1Q15648 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MED1Q15648 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MED1Q15648 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MED1Q15648 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MED1Q15648 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MED1Q15648 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MED1Q15648 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
MED1Q15648 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
MED1Q15648 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MED1Q15648 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
MED1Q15648 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MED1Q15648 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms