Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF1Q15637 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF1Q15637 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF1Q15637 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF1Q15637 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF1Q15637 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF1Q15637 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF1Q15637 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF1Q15637 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF1Q15637 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF1Q15637 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF1Q15637 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF1Q15637 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF1Q15637 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SF1Q15637 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF1Q15637 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF1Q15637 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF1Q15637 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF1Q15637 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF1Q15637 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF1Q15637 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF1Q15637 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF1Q15637 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF1Q15637 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF1Q15637 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF1Q15637 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF1Q15637 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF1Q15637 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF1Q15637 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF1Q15637 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF1Q15637 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF1Q15637 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF1Q15637 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF1Q15637 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF1Q15637 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF1Q15637 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF1Q15637 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF1Q15637 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF1Q15637 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF1Q15637 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SF1Q15637 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF1Q15637 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF1Q15637 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF1Q15637 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF1Q15637 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF1Q15637 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF1Q15637 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF1Q15637 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF1Q15637 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF1Q15637 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF1Q15637 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF1Q15637 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF1Q15637 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF1Q15637 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF1Q15637 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF1Q15637 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF1Q15637 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF1Q15637 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF1Q15637 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF1Q15637 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF1Q15637 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF1Q15637 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF1Q15637 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF1Q15637 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF1Q15637 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF1Q15637 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF1Q15637 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF1Q15637 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF1Q15637 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF1Q15637 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF1Q15637 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SF1Q15637 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF1Q15637 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF1Q15637 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF1Q15637 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF1Q15637 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF1Q15637 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF1Q15637 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF1Q15637 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF1Q15637 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF1Q15637 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF1Q15637 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF1Q15637 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF1Q15637 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF1Q15637 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF1Q15637 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF1Q15637 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF1Q15637 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF1Q15637 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF1Q15637 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF1Q15637 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF1Q15637 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF1Q15637 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF1Q15637 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF1Q15637 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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