Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRADDQ15628 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRADDQ15628 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRADDQ15628 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRADDQ15628 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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