Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIV2LQ15477 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKIV2LQ15477 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKIV2LQ15477 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SKIV2LQ15477 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKIV2LQ15477 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIV2LQ15477 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKIV2LQ15477 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms