Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5R1Q15078 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5R1Q15078 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5R1Q15078 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5R1Q15078 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R1Q15078 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R1Q15078 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms