Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
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