Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERPUD1Q15011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD1Q15011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD1Q15011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms