Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF1Q14990 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF1Q14990 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF1Q14990 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF1Q14990 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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