Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFTN1Q14699 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFTN1Q14699 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFTN1Q14699 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFTN1Q14699 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RFTN1Q14699 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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