Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLS1Q14651 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PLS1Q14651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLS1Q14651 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLS1Q14651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLS1Q14651 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLS1Q14651 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
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