Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

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Length 4,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAT1Q14517 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAT1Q14517 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAT1Q14517 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAT1Q14517 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAT1Q14517 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms