Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BECN1Q14457 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BECN1Q14457 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BECN1Q14457 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BECN1Q14457 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BECN1Q14457 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
BECN1Q14457 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
BECN1Q14457 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
BECN1Q14457 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
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