Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
UBE4AQ14139 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UBE4AQ14139 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
UBE4AQ14139 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
UBE4AQ14139 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBE4AQ14139 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
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UBE4AQ14139 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
UBE4AQ14139 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBE4AQ14139 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
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