Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms