Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A4Q13733 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A4Q13733 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A4Q13733 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A4Q13733 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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