Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CUL4AQ13619 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CUL4AQ13619 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL4AQ13619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CUL4AQ13619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CUL4AQ13619 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL4AQ13619 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL4AQ13619 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
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