Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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