Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGADQ13349 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGADQ13349 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGADQ13349 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGADQ13349 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGADQ13349 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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