Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 216.54■□□□□ 0.248e-13■■■■□ 25.9
G3BP1Q13283 SPTAN1-219ENST00000629378 585 ntTSL 211.12□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-201ENST00000306026 1905 ntTSL 224.2■■□□□ 1.466e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.385e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)22.96■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 VPS51-204ENST00000527646 2144 ntTSL 1 (best)22.73■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 VPS51-213ENST00000533827 1078 ntTSL 321.53■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 VPS51-208ENST00000530673 633 ntTSL 521.53■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 VPS51-216ENST00000534591 1503 ntTSL 521.01■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ANKHD1-217ENST00000495578 718 ntTSL 217.74■□□□□ 0.436e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 25.8
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G3BP1Q13283 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.176e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ANKHD1-208ENST00000421706 801 ntTSL 214.26□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ALDH7A1-208ENST00000485852 579 ntTSL 214.21□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 USP19-204ENST00000398896 3907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 NUMA1-216ENST00000540588 216 ntTSL 211.16□□□□□ -0.624e-13■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 RPAP1-211ENST00000568413 586 ntTSL 311.04□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ATXN10-208ENST00000476998 482 ntTSL 310.9□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ANKHD1-EIF4EBP3-201ENST00000437495 2243 ntTSL 510.25□□□□□ -0.776e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 27.2□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 520.21■□□□□ 0.835e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 215.92■□□□□ 0.145e-6■■■■□ 25.8
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G3BP1Q13283 WARS-230ENST00000556504 847 ntTSL 512.86□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-220ENST00000554950 1376 ntTSL 211.92□□□□□ -0.55e-6■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-6■■■■□ 25.8
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G3BP1Q13283 DHX8-203ENST00000587044 6215 ntTSL 214.26□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 DHX8-201ENST00000262415 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.853e-7■■■■□ 25.8
G3BP1Q13283 TCP1-209ENST00000538128 557 ntTSL 428.3■■■□□ 2.122e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 TCP1-208ENST00000537390 691 ntTSL 524.66■■□□□ 1.542e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 TCP1-213ENST00000543517 561 ntTSL 423.35■■□□□ 1.332e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 CEP250-205ENST00000425096 629 ntTSL 321.27■■□□□ 12e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 CEP250-207ENST00000425934 2156 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 CEP250-209ENST00000461386 2295 ntTSL 216.08■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 SVIL-213ENST00000632315 2889 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 OAT-202ENST00000467675 810 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 25.7
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G3BP1Q13283 OAT-203ENST00000471127 751 ntTSL 29.95□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 TCP1-212ENST00000539948 706 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 25.7
G3BP1Q13283 TCP1-205ENST00000536394 535 ntTSL 45.92□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 25.7
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G3BP1Q13283 NUP155-204ENST00000507233 459 ntTSL 42.33□□□□□ -2.042e-7■■■■□ 25.7
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G3BP1Q13283 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 25.6
G3BP1Q13283 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-7■■■■□ 25.6
G3BP1Q13283 PSMA6-205ENST00000554457 4730 nt8.72□□□□□ -1.013e-11■■■■□ 25.6
G3BP1Q13283 PRDX6-202ENST00000460950 809 ntTSL 212.43□□□□□ -0.424e-19■■■■□ 25.6
G3BP1Q13283 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 316.93■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 25.6
G3BP1Q13283 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 25.5
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G3BP1Q13283 GLOD4-208ENST00000574554 1314 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-215ENST00000576419 705 ntTSL 313.11□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-201ENST00000301328 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-214ENST00000576239 2737 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-204ENST00000571073 2311 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-213ENST00000575851 1063 ntTSL 310.43□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-210ENST00000575528 585 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 GLOD4-206ENST00000573137 447 ntTSL 36.02□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.373e-7■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 CTNNB1-211ENST00000465552 878 ntTSL 212.3□□□□□ -0.448e-10■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -16e-16■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.166e-16■■■■□ 25.5
G3BP1Q13283 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 37.77□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 25.4
G3BP1Q13283 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 25.57□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 25.4
G3BP1Q13283 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 214.3□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 25.4
G3BP1Q13283 TLN1-206ENST00000486788 551 ntTSL 519.77■□□□□ 0.762e-8■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 GSPT1-207ENST00000564790 491 ntTSL 34.09□□□□□ -1.756e-8■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.037e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 17e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 521.06■□□□□ 0.967e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.877e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.657e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PSMC4-205ENST00000601194 650 ntTSL 317.69■□□□□ 0.426e-10■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-7■■■■□ 25.3
G3BP1Q13283 PHGDH-224ENST00000641711 712 nt12.48□□□□□ -0.417e-8■■■■□ 25.2
G3BP1Q13283 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 25.2
G3BP1Q13283 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 25.2
G3BP1Q13283 PRKDC-211ENST00000546304 589 ntTSL 27.8□□□□□ -1.163e-8■■■■□ 25.2
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