Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCOCO2Q13137 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO2Q13137 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALCOCO2Q13137 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALCOCO2Q13137 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCOCO2Q13137 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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