Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1BQ13112 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1BQ13112 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAF1BQ13112 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAF1BQ13112 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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