Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC16Q13042 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC16Q13042 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC16Q13042 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC16Q13042 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC16Q13042 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms