Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFRD2Q12894 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFRD2Q12894 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFRD2Q12894 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFRD2Q12894 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFRD2Q12894 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFRD2Q12894 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFRD2Q12894 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFRD2Q12894 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFRD2Q12894 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFRD2Q12894 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFRD2Q12894 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFRD2Q12894 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFRD2Q12894 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFRD2Q12894 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFRD2Q12894 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFRD2Q12894 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFRD2Q12894 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFRD2Q12894 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFRD2Q12894 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFRD2Q12894 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFRD2Q12894 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFRD2Q12894 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFRD2Q12894 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFRD2Q12894 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFRD2Q12894 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFRD2Q12894 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFRD2Q12894 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFRD2Q12894 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFRD2Q12894 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms